Uzrok unutarnje diskoloracije pojedinog zuba može biti dentalna trauma ili neadekvatna endodontska terapija (liječenje zuba). Traumatske povrede zubi često dovode do pucanja žila koje se nalaze u pulpi zuba pri čemu dolazi do krvarenja i hemolize. Ovim procesom nastaju spojevi željeza i sumpora koji se razlažu na pigmente koji prodiru u dentinske kanaliće i boje zube u tamno. Ukoliko je diskoloracija zubi posljedica endodontaske terapije, uzrok može biti zaostalo pulpno tkivo ili nedovoljno čišćenje i brtvljenje kanala.
Metoda unutarnjeg izbjeljivanja zuba naziva se „walking bleach“ metoda i potpuno je bezbolna za pacijenta. Nakon trepanacije zuba, ponekad je potrebno napraviti reviziju punjenja kanala. Nakon toga u zub se stavlja zaštitna podloga te se u zub unosi sredstvo za izbjeljivanje (gusta smjesa natrijeva perborata i vode, vodikov peroksid ili karbamid peroksid gel). Zatim se zub zatvara privremenim ispunom. Sredstvo za izbjeljivanje ostaje u zubu od 2 do 7 dana. Nakon što zub postigne željenu nijansu, ukanjamo ostatke sredstva za izbjeljivanje te postavljamo konačni ispun. Ako nismo zadovoljni postignutom bojom, postupak se može ponoviti.